Guanidino hidrochlorido vaidmuo baltymų denatūracijoje

Baltymai yra jautresni išoriniams veiksniams (temperatūrai, denatūrantams ir t. t.), kad pasikeistų konformaciniai pokyčiai, dėl kurių prarandamas aktyvumas ir pasikeičia fizinės ir cheminės savybės. Šis procesas vadinamas baltymų denatūravimu.Guanidino hidrochloridasyra svarbus denatūravimo agentas, galintis sukelti stiprų denatūravimo efektą, apimantį du denatūravimo mechanizmus.

Vienas iš jų yra tirpinimo efektasguanidino hidrochloridasant hidrofobinių aminorūgščių liekanų. Guanidino hidrochloridas gali nutraukti vandenilio jungtis baltymų struktūroje, o tai padidina nepolinių molekulių, įskaitant aminorūgščių šonines grandines, tirpumą ir sumažina hidrofobinę sąveiką; Kitas mechanizmas yra tas, kad denatūruoti baltymai gali jungtis su guanidino hidrochloridu, sudarydami denatūruotus baltymus -denatūracinį kompleksą. Pašalinus kompleksą, reakcijos pusiausvyra pasislenka į dešinę, o natūralios būklės baltymas nuolat virsta kompleksu, o tai galiausiai lemia visišką baltymo denatūraciją. Tačiau denatūravimo agentų prisijungimas prie denatūruotų baltymų yra labai silpnas, ir tik didelė denatūravimo agentų koncentracija gali sukelti visišką baltymų denatūraciją. Apskritai, guanidino hidrochlorido sukelta denatūracija paprastai yra grįžtama.